Chasseurs-cueilleurs: des études génomiques

Gravettien-Reconstitution dun chasseur-cueilleur associé à la culture gravettienne présente dans toute l'Europe -32 000-24 000 ans - Crédit-Tom Bjoerklund
1- Paléogénomique des chasseurs-cueilleurs européens du Paléolithique supérieur au Néolithique
(https://www.nature.com/articles/s41586-023-05726-0) - https://www.haaretz.com/archaeology/2023-03-01/ty-article/study-of-age-hunters-changes-what-we-know-about-european-ancestry/- traductions partielles en français.
La plus grande analyse génétique jamais réalisée sur les chasseurs-cueilleurs de la période glaciaire à ce jour, a mis en lumière les mouvements humains avant, pendant et après le Dernier Maximum Glaciaire (LGM) il y a environ 25 000 à 19 000 ans. Alors que les grandes calottes glaciaires descendaient du nord, les gens ont en effet fui vers le sud, selon l' étude publiée début mard 2023 dans Nature par le professeur Cosimo Posth de l'Université de Tübingen avec des chercheurs du Centre Senckenberg pour l'évolution humaine et le paléoenvironnement, l'Université de Pékin et le Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology à Leipzig, en collaboration avec 125 scientifiques internationaux.
Outils, art et autres artefacts culturels ont conduit les chercheurs à définir deux cultures paneuropéennes de la période glaciaire : l'aurignacien, qui a émergé peu après l'arrivée de sapiens (YH : ? et/ou qu'il a amené en partie de ses origines et rencontres (néandertaliennes aussi), suivi du gravettien d'il y a environ 33 000 ans. Les deux couvraient plus ou moins toute l'Europe occidentale, méridionale et centrale.
Il s'avère que les Aurignaciens d'Europe de l'Est et de l'Ouest, avant il y a 33 000 ans, étaient génétiquement très différents les uns des autres. Les Aurignaciens ont engendré les Gravettiens, et les caractéristiques du Gravettien se retrouvent de la péninsule ibérique à l'ouest jusqu'à la Crimée à l'est.
Sur la base de caractéristiques culturelles et morphologiques crâniennes partagées, les Gravettiens étaient supposés partager un profil d'ascendance.
Mais ce n'est pas le cas, selon l'analyse génomique de 356 anciens chasseurs-cueilleurs vivant il y a 35 000 à 5 000 ans en Europe occidentale, centrale et méridionale - d'avant le dernier maximum glaciaire jusqu'au Chalcolithique : les Européens de l'Ouest associés au Gravettien descendent des populations aurignaciennes occidentales, tandis que les Européens du centre et du sud associés au Gravettien dérivent des populations aurignaciennes de leurs régions.
Carte de localisation de la culture Homo Sapiens de l'Aurignacien, il y a entre 37 000 et 28 000 ans. © Sémhur / Wikimedia Commons - CC BY-SA 4.0
Résumé : " Les humains modernes ont peuplé l'Europe pendant plus de 45 000 ans 1 , 2 . Notre connaissance de la parenté génétique et de la structure des anciens chasseurs-cueilleurs est cependant limitée, en raison de la rareté et de la mauvaise conservation moléculaire des restes humains de cette période 3 . Ici, nous analysons 356 anciens génomes de chasseurs-cueilleurs, y compris de nouvelles données génomiques pour 116 individus de 14 pays d'Eurasie occidentale et centrale, d'il y a entre 35 000 et 5 000 ans. Nous identifions un profil d'ascendance génétique chez les individus associés aux assemblages du Gravettien du Paléolithique supérieur d'Europe occidentale qui est distinct des groupes contemporains liés à cette culture archéologique en Europe centrale et méridionale 4, mais ressemble à celui des individus précédents associés à la culture aurignacienne. Ce profil d'ascendance a survécu pendant le dernier maximum glaciaire (il y a 25 000 à 19 000 ans) dans les populations humaines du sud-ouest de l'Europe associées à la culture solutréenne et à la culture magdalénienne suivante qui s'est ré-étendue vers le nord-est après le dernier maximum glaciaire. À l'inverse, nous révélons un renouvellement génétique dans le sud de l'Europe suggérant un remplacement local des groupes humains à l'époque du dernier maximum glaciaire, accompagné d'une dispersion nord-sud des populations associées à la culture épigravettienne. Il y a au moins 14 000 ans, une ascendance liée à cette culture s'est propagée du sud à travers le reste de l'Europe, remplaçant en grande partie le pool génétique associé au Magdalénien."
" Les humains modernes ont quitté l'Afrique subsaharienne il y a au moins 60 000 ans (ka), et lors de leur expansion initiale en Eurasie, ils se sont mélangés génétiquement avec des Néandertaliens, ce qui a donné 2 à 3% d'ascendance néandertalienne dans la majorité des populations non africaines actuelles 5. Les données génomiques ont montré que les humains modernes étaient présents dans l'ouest de l'Eurasie 1, 2 au moins 45 ka (YH: 55 ka plutôt maintenant). Certains de ces premiers groupes datant de plus de 40 ka se sont encore mélangés à des Néandertaliens, comme le montrent les signaux d'introgression récente chez des individus de Bacho Kiro en Bulgarie - associés à une culture archéologique du Paléolithique supérieur initial (IUP) - et de Peştera cu Oase en Roumanie 2 , 6. D'autres individus de cette période, tels que Zlatý kůň de Tchéquie et Ust'Ishim de Russie, ne portent pas beaucoup plus d'ascendance néandertalienne que d'autres groupes non africains 1 , 7 , indiquant des interactions différentielles entre les Néandertaliens et les premiers humains modernes lors de leurs expansions initiales à travers Eurasie. Étonnamment, cependant, aucun de ces individus d'avant 40 ka n'a laissé de traces substantielles dans la constitution génétique des populations eurasiennes actuelles 1 , 2 , 6 , 7. Les génomes les plus anciens portant des ancêtres qui dérivent principalement de la lignée menant aux Européens actuels sont Kostenki 14 (à partir de 37 ka, avec une association archéologique incertaine de l'ouest de la Russie), Goyet Q116-1 (35 ka, associé à l'Aurignacien de Belgique) et Bacho Kiro 1653 (35 ka, probablement associé à l'Aurignacien de Bulgarie) 2 , 4 , 8 . Ces données suggèrent que les ascendances génétiques identifiées chez les individus pré-40 ka analysés jusqu'à présent se sont largement éteintes ou ont été assimilées par des expansions ultérieures 1 , 9. La signature génétique de Kostenki (liée au génome de Kostenki 14, et ci-après dénommée groupe ou ascendance Kostenki) a contribué au dernier groupe génétique Věstonice (ci-après, groupe ou ascendance Věstonice), du nom du site Dolní Věstonice en Tchéquie 4. Cette signature génétique est partagée par les individus associés à la culture gravettienne définie archéologiquement (33-26 ka) en Europe centrale et méridionale et a apparemment disparu après le Dernier Maximum Glaciaire 4 (LGM). Cependant, le profil génétique des individus contemporains associés au Gravettien d'Europe occidentale reste inconnu, tout comme leur contribution aux populations après le LGM. Connue pour avoir été la phase la plus froide de la dernière période glaciaire, la LGM est considérée comme ayant provoqué un déclin démographique dans de grandes parties de l'Europe 10, avec des populations se rétractant vers les latitudes méridionales comme en témoigne, par exemple, la contemporanéité de la culture solutréenne ( 24-19 ka) dans la péninsule ibérique et le sud de la France. D'autres refuges climatiques proposés pour la survie humaine au cours de cette période sont la péninsule italienne, les Balkans et la plaine européenne du sud-est, mais la contribution génétique réelle des populations de ces régions aux Européens post-LGM est fortement débattue 11, 12, 13.
Après le LGM, une composante génétique lointainement liée à l'individu Goyet Q116-1 de Belgique daté de 35 ka - nommée ascendance GoyetQ2 (ci-après, groupe ou ascendance GoyetQ2) - est réapparue (YH : migration) chez des individus du sud-ouest et d'Europe centrale associés à la culture magdalénienne (19 –14 ka, de la péninsule ibérique à l'Europe de l'Est à travers l'Europe centrale) et sous une forme mixte chez les chasseurs-cueilleurs du Paléolithique final et du Mésolithique ultérieurs 4, 14, mais l'extension géographique de cette ascendance n'est toujours pas claire. Au lieu de cela, dans le sud de l'Europe, un profil génétique distinct de chasseurs-cueilleurs a été trouvé dès 17 ka chez des individus associés à la culture épigravettienne 15 (24–12 ka, de la péninsule italienne au sud-est de la plaine européenne à travers les Balkans). Cette ascendance « Villabruna » (ci-après, groupe ou ascendance Villabruna) a montré des liens avec les populations anciennes et actuelles du Proche-Orient 4, 16, mais le mode et le rythme de son expansion dans la péninsule italienne restent inexplorés. L'ascendance Villabruna est apparue plus tard en Europe centrale et on pense qu'elle a largement remplacé les groupes liés à l'ascendance GoyetQ2 4. Cependant, sa formation, sa diffusion et son interaction avec les chasseurs-cueilleurs contemporains d'Europe de l'Est et leur interaction avec les expansions ultérieures des agriculteurs néolithiques du sud-est de l'Europe ne sont pas bien caractérisées.
Dans cette étude, nous analysons 356 anciens génomes de chasseurs-cueilleurs, y compris de nouvelles données génomiques de 116 individus datés de 35 à 5 ka, ainsi qu'une nouvelle méthode d'estimation de la contamination basée sur des cycles d'homozygotie. Nous fournissons une description systématique des transformations génomiques que les groupes de chasseurs-cueilleurs ont subies depuis le début du Paléolithique supérieur à travers l'Eurasie occidentale et centrale et comment celles-ci sont éventuellement liées aux changements culturels et climatiques.